广东畜牧兽医科技 ›› 2021, Vol. 46 ›› Issue (6): 40-44.

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藏猪出生重的全基因组关联分析

胡斌#,蔡淑芳#,孟繁明,辛海云,王塑天,李宝红,程蕾燕,李剑豪*   

  1. (广东省农业科学院动物科学研究所,畜禽育种国家重点实验室,广东省动物育种与营养 公共实验室,广东省畜禽育种与营养研究重点实验室,广东 广州 510640)
  • 收稿日期:2021-11-02 出版日期:2021-12-18 发布日期:2021-12-18
  • 通讯作者: 李剑豪
  • 基金资助:
    广东省重点领域研究与发展计划(2018B0020303);金华市科技规划项目(2019?2?004);广东省现代农业产业技术体系生猪创新团 队(2021KJ126)

  • Received:2021-11-02 Online:2021-12-18 Published:2021-12-18

摘要: 出生体重是影响仔猪质量和存活的一个重要性状。本研究利用206头藏猪仔猪群 体,提取耳组织样品DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型填 充后,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS),筛选该群体的出生重性状相关 基因。结果显示:GEMMA软件共检测到5个达到染色体显著水平(P<5.6*10-6)的SNP位点,筛 选了 TMC1、PRUNE2、FOXB2、XIRP2、ENSSSCG00000005264、ENSSSCG00000022408 和 ENSSS? CG00000030243作为出生重性状候选基因,为后续通过分子育种手段提升藏猪出生重性状奠 定了基础。

关键词: 猪; 出生重; 全基因组关联分析; SNP

中图分类号: