广东畜牧兽医科技 ›› 2017, Vol. 42 ›› Issue (5): 35-37.

• • 上一篇    

一株猪捷申病毒全基因组序列测定及分析

黎少国1,张建峰2,张春红2,沈海燕2,刘志成2**   

  1. (1. 惠州东进农牧股份有限公司,广东 惠州 51300; 2. 广东省农业科学院动物卫生研究所,广东省兽医公共卫生公共实验室,广东省畜禽疫病防治研究重 点实验室,广东 广州 510640)
  • 收稿日期:2017-09-04 出版日期:2017-10-18 发布日期:2017-10-18
  • 通讯作者: 刘志成
  • 基金资助:
    广东省科技计划项目(2016B020234006, 2014A020209061)

  • Received:2017-09-04 Online:2017-10-18 Published:2017-10-18

摘要: 根据 GenBank 已发表的猪捷申病毒(porcine teschovirus,PTV)13 种血清型全基因组序列,分 析其保守区域并设计 10 对特异性引物。从临床腹泻病料中提取核酸,经 RT-PCR 扩增目的片段 , 分别对这些片 段进行克隆、序列测定、拼接,最终获得一株猪捷申病毒全基因组序列,命名为 PT-GD。主要结构蛋白 VP1 进化 分析表明,该毒株与 PTV12 型 CC25、YZ119 的 VP1 核苷酸序列同源性分别为 80.1 % 和 79.7 %,与其他血清型毒 株进化距离相对较远,表明该毒株为猪捷申病毒血清型 12 型。该病毒全基因序列的测定及血清型鉴定为进一步 深入研究猪捷申病毒在我国的遗传变异及其生物学特性提供了依据。

关键词: 猪捷申病毒;全基因组;序列测定;VP1

中图分类号: